Bon, je ne connaissais pas les écoles dont tu parlais ni les villes d'ailleurs puisque je n'y suis jamais allé. Cependant étant en école d'ingé à Nantes, à défaut de te conseiller vraiment, je peux peut-être t'aider à te poser quelques questions utiles 
En ce qui concerne le prix des études, s'il s'agit d'un facteur déterminant, c'est naturellement avec tes parents que tu dois en discuter. La possibilité de travailler en parallèle existe, mais dans les grandes agglo c'est pas forcément évident de trouver. Et surtout pendant les deux années de prépa intégrée, c'est inenvisageable car ton emploi du temps est très chargé 
Pour la distance de l'école et de la maison, étant de Nantes et faisant mes études dans cette même ville, je n'ai pas eu ce souci. En revanche des personnes viennent de Brest, de Toulouse, de Paris, bref compter entre 3h et 5h de route en fonction. Ca n'est pas facile au départ, surtout quand on ne connait personne, mais on est vite dans le bain, on fait connaissance et on développe son autonomie rapidement. Seules les premières semaines sont délicates en général.
En ce qui concerne la formation, les deux étant des écoles d'ingé généralistes, il y aura forcément des cours qui ne t'attireront pas. Mon école est généraliste et j'avoue que les cours d'automatique par exemple sont pas ceux qui m'intéresse le plus ( :notme2: ). Le truc étant que la formation te donne les outils pour pouvoir t'adapter plus tard dans ton environnement de travail.
Mais c'est sur que si la formation de l'ISEN correspond plus à ce que tu souhaites, c'est un point à prendre en compte. N'oublie pas que tu vas d'abord te former dans quelque chose qui doit te correspondre. Si tu as déjà une idée de ce que tu veux faire plus tard, regarde laquelle des deux te permettrait d'y arriver au mieux.
Concernant l'embauche, on peut le dire : aujourd'hui il n'est pas difficile de trouver du travail avec un diplôme d'ingé en poche. Il suffit de regarder la moyenne de la durée de recherche d'emploi à la sortie des écoles pour s'en rendre compte (sans compter que certains étudiants prennent délibérément des vacances après l'obtention du diplôme). Et la tendance n'est pas défavorable. Ne t'inquiète pas pour ça, je serais toi j'en ferais pas un point décisif.
Une remarque concernant le logement. Visiblement dans les deux cas tu as possibilité de trouver un logement. Pour ma part j'étais dans la résidence étudiante de l'école et c'était vraiment l'idéal pour s'intégrer dans la promotion. On lie beaucoup plus facilement contact, on est proche les uns des autres, la solidarité se crée pendant les deux premières années, souvent denses et difficiles. Le fait d'avoir la plupart de ses camarades à quelques coulois ou quelques portes, ça aide forcément. Après, ça ne veut pas dire que ceux qui ne le font pas sont exclus
C'est juste que, de part mon expérience ces "externes" doivent faire un effort supplémentaire afin de s'intégrer plus facilement. Là encore naturellement, il y a l'aspect financier qui entre en compte. Et puis si l'ESSTIN n'a pas de résidence, ce problème ne se pose pas.
Ca m'amène à parler de la taille des promotions. Si pas mal d'écoles arrivent à créer ces esprits de promo, c'est parce qu'en général il y a environ une centaine d'étudiants par promotion, et je considère ça comme un atout car ça reste à dimension humaine. Tout le monde se connaît et on est loin des promotions énormes (genre 500 ) de certaines.
Autre point : comparer les deux formation d'un point de vue professionalisant. Est-ce que les liens avec les entreprises sont nombreux ? Est-ce qu'il y a beaucoup de stages, de quelle durée ? C'est important de sortir de l'école et de goûter au monde de l'entreprise le plus possible. On a un aperçu de ce dans quoi on va mettre les pieds.
Enfin, les écoles offrent quelles possibilités d'aller à l'étranger ? Séjour obligatoire, stages, période de césure, études à l'étranger (ERASMUS) ? Pour travailler les langues rien de tel qu'un petit voyage 
Enfin c'est vrai que tu peux avoir tendance à faire ton choix parce que tu y retrouveras tes amis. De ce côté là, à moins que tu ne sois un asociable né, tu te feras de nouveaux potes très rapidement. La plupart des étudiants qui débarquent ne connaissent non plus personne. Il ne faut donc pas que ce soit un frein dans ta prise de décision.
Voilà, je t'ai donné les aspects qui avaient compté pour moi. J'espère que ça t'aidera. Sache en tout cas que visiblement aucune des deux écoles n'est mauvaise
Tu as du choix entre du bon et du bon, ce qui est déjà une excellente chose
"Quand tu es poursuivi, rien ne sert de courir plus vite que la menace, il faut courir plus vite que tes potes". Proverbe gobelin