Je n'ai jamais joué à BG avec une équipe customisé, mais je peux au moins répondre à tes autres questions 
Dans BG1 effectivement, les relations entre PNJ sont très rares, et aucun PNJ n'est indispensable à l'histoire. A mon avis tu ne perdras rien à jouer à Baldur avec une équipe personnalisée, si ce mode de jeu te plaît.
Par contre, ce n'est plus du tout pareil dans BG2... Au moins un PNJ est dépendant du scénario, les PNJ ont de réelles interactions, mais aussi leurs propres quêtes, que tu ne peux avoir qu'en ayant le PNJ en question. Enfin, il y a les romances PJ/PNJ (et même une PNJ/PNJ). L'aspect RP avec les PNJ est très développé et extrêmement présent dans BG2. Néanmoins, tu peux évidemment aussi jouer avec une équipe de 6 persos dans BG2, mais là tu y perdras beaucoup.
Administrateur en charge de la technique et de la rubrique Neverwinter Nights - Modérateur du Bazar de l'Aventurier et de Baldur's Gate Enhanced Edition